鏈物流基礎設施相對落后是我國冷鏈利用率偏低的主要原因之一，主要表現(xiàn)在以下兩個方面。
　　冷藏運輸上，目前我國在冷鏈中用于運輸?shù)膶ｉT車輛很大部分來自于海運報廢或即將淘汰的海運冷藏集裝箱，專業(yè)化的冷凍冷藏車數(shù)量嚴重不足。車輛的制冷技術和工藝比較落后，缺乏規(guī)范式的保鮮冷鏈運輸車廂和溫度控制設施，無法為易腐食品的流通提供質(zhì)量保障。冷藏運輸率，即易腐貨物采用冷藏運輸所占的比例只有10%～20%，而歐、美、日等發(fā)達國家均達到80%～90%。但我國每年的冷藏物流損失超過750億元，運輸過程中的高損耗使得整個物流費用占到運輸產(chǎn)品成本的70%，而國際標準上這一指標最高不超過50%。
　　冷庫建設上，我國目前冷庫總?cè)萘?00多萬立方米，相比市場需求而言缺口仍然較大，而且各類冷庫的結(jié)構并不合理，大型冷庫項目較多，批發(fā)零售冷庫建設相對較少;肉類冷庫建設較多，果蔬冷庫建設還比較落后;城市銷售市場冷庫發(fā)展較快，產(chǎn)地加工冷庫建設比較緩慢。
　　尚未形成完整體系
　　無論是從我國經(jīng)濟發(fā)展的消費內(nèi)需來看，還是與發(fā)達國家相比，我國冷鏈都尚未形成完整的體系。歐美日本等發(fā)達國家農(nóng)產(chǎn)品進入冷鏈系統(tǒng)流通的在90%以上，而我國目前進入冷鏈系統(tǒng)的蔬菜類比重只占到全部蔬菜的5%，肉類只占到15%，水產(chǎn)品也只有23%。即使是使用冷鏈運輸?shù)漠a(chǎn)品，在從產(chǎn)地到流入集貿(mào)市場拆散零賣的過程中冷鏈也存在中斷的現(xiàn)象，并不完整。
　　因此，在我國農(nóng)產(chǎn)品冷鏈物流體系建設中，要特別強調(diào)“鏈”的完整性。發(fā)展農(nóng)產(chǎn)品冷鏈不等于盲目建冷庫，而是要從農(nóng)產(chǎn)品運輸?shù)娜^程入手，加強市場對整個鏈條的控制，這需要通過冷鏈中的各個環(huán)節(jié)之間相互協(xié)調(diào)、建立完善信息追溯機制和大力發(fā)展第三方監(jiān)控等措施來保證。
　　第三方物流拖后腿
　　目前，我國的第三方物流還主要是以提供貨物代理、庫存管理、搬運和定向運輸?shù)葮I(yè)務為主，很少有物流企業(yè)能夠能提供全面、綜合、集成的冷鏈物流服務。正是由于第三方冷鏈物流的發(fā)展滯后，物流服務覆蓋的網(wǎng)絡有限，以及物流信息系統(tǒng)建設緩慢，冷鏈物流的質(zhì)量、準確性和及時性都難以保證，一方面產(chǎn)生較高的冷鏈物流成本，另一方面又無法避免較高的商品損耗率。因此，多數(shù)生產(chǎn)廠家要么止步于第三方冷鏈物流的高成本，要么擔心冷藏物流業(yè)務外包后的安全問題，只能是自行經(jīng)營，或是部分或區(qū)域性的外包。其中企業(yè)自營冷鏈物流占到了物流總量的80%，只有20%的物流通過第三方來實現(xiàn)。這反過來又在一定程度上阻礙了第三方冷鏈物流的發(fā)展。
　　如三全、思念等大型食品企業(yè)，大多依靠自己的冷鏈物流來完成服務，其擁有自營物流公司并配有多輛冷藏食品車輛。雖然這些車輛的日常維護保養(yǎng)費用十分巨大，而且有一定程度的運力浪費，但大多數(shù)第三方物流企業(yè)很難達到肉類食品物流配送對時間、儲存條件等方面的要求。
　　冷鏈物流標準缺失
　　一個行業(yè)能夠穩(wěn)步發(fā)展需要相關的國家標準作為保證，以此對已進入市場和即將進入市場的企業(yè)進行規(guī)范化、標準化管理。
　　到目前為止，我國在冷鏈物流上尚無一個統(tǒng)一的可供參考與執(zhí)行并具有廣泛約束力的標準，例如在冷鏈能損與效率、作業(yè)操作規(guī)范、食品衛(wèi)生安全、溫度控制、管理要求、設備標準、運營流程等都方面都沒有明確和統(tǒng)一的規(guī)定，從而制約了我國冷鏈物流業(yè)的健康發(fā)展。
　　技術和管理水平不高
　　標準的缺失也在一定程度上制約了我國冷鏈物流技術和管理水平的提高。
　　目前，我國農(nóng)產(chǎn)品流通中有效的溫度控制設施仍然缺乏，控制技術有待提高，操作相應設施的專業(yè)人員嚴重缺乏，信息流通不暢，冷鏈全過程的運行管理制度亟待建立。在這種情況下，各個環(huán)節(jié)信息阻塞，冷凍類產(chǎn)品在運輸途中易發(fā)生無謂耽擱，風險增多，而應急能力較弱，因此嚴重制約了我國物流業(yè)的發(fā)展。
　　農(nóng)業(yè)發(fā)展水平落后
　　我國農(nóng)業(yè)仍然以散戶種植為主，機械化和標準化程度較低，產(chǎn)業(yè)集中度不高。這對冷鏈的建設提出了嚴峻的挑戰(zhàn)。農(nóng)產(chǎn)品種植機械化和標準化程度低，導致農(nóng)產(chǎn)品種植成本較高，產(chǎn)品附加值低，而產(chǎn)地分散，使得冷鏈的效益難以體現(xiàn)出來，在什么地方、什么環(huán)節(jié)建冷庫也相對難以論證